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深入理解RNA轉錄組學:從樣本采集開始

更新時間:2023-11-01

閱讀:443

今天我(wo)們(men)將探討一個(ge)與生物(wu)學和基因研究(jiu)密(mi)切相關(guan)的領域——RNA轉(zhuan)錄組學。在這個(ge)學科中(zhong),研究(jiu)者們(men)主要關(guan)注細胞內所有基因活性表(biao)達(da)的信息,即RNA分子。而(er)這些(xie)信息的獲取則始(shi)于一項(xiang)至關(guan)重要的工作(zuo)——樣本采集。

那么,究竟什么是(shi)RNA轉錄(lu)組(zu)學呢?簡(jian)單來說,它(ta)是(shi)一(yi)種利用高通量測序(xu)技術分(fen)析細胞、組(zu)織(zhi)或(huo)器官中的RNA分(fen)子的技術。這些RNA分(fen)子包括mRNA(編碼蛋白(bai)質的RNA)、lncRNA(長鏈(lian)非(fei)編碼RNA)等不同(tong)類型,它(ta)們代表(biao)了(le)基因在(zai)特定時間和空間內(nei)的活性(xing)狀(zhuang)態(tai)。

RNA轉(zhuan)錄(lu)組(zu)學(xue)的重要性(xing)在(zai)于它能夠幫助我們(men)了解基因如何控制(zhi)生(sheng)命過(guo)程(cheng),如生(sheng)長(chang)發(fa)育、生(sheng)理代謝以(yi)及疾病(bing)的發(fa)生(sheng)發(fa)展等。同時(shi),通過(guo)對不同組(zu)織、不同個體或(huo)不同病(bing)程(cheng)的RNA進(jin)行比較(jiao)分析,還能發(fa)現關鍵(jian)性(xing)的差異表達基因,從而(er)揭示潛在(zai)的藥(yao)物靶點或(huo)診斷標志物。

然而,在(zai)開始RNA轉(zhuan)錄(lu)組(zu)學(xue)研究(jiu)之(zhi)前,必須首先解決的(de)問(wen)題是(shi)如何正確地采(cai)集和保存樣本(ben)。這是(shi)因為細胞內的(de)RNA十分(fen)不穩定,容易降(jiang)解或發生變異,從(cong)而影響后續的(de)研究(jiu)結果(guo)。以下是(shi)一些(xie)關于(yu)RNA轉(zhuan)錄(lu)組(zu)學(xue)樣品(pin)采(cai)集的(de)基本(ben)原則:

  1. 樣(yang)品類型(xing):選(xuan)擇具有(you)代(dai)表(biao)性(xing)且便于獲取的(de)(de)樣(yang)品類型(xing),如(ru)血液、組織切片、細胞(bao)培養物等。需要注意(yi)的(de)(de)是,不(bu)同的(de)(de)組織類型(xing)的(de)(de)RNA豐度可能(neng)有(you)所(suo)不(bu)同,應根據研(yan)究目(mu)的(de)(de)合理選(xuan)擇。

  2. 樣品數(shu)量:通常要求至(zhi)少50-100mg新鮮組織(zhi),或(huo)者至(zhi)少1x106個細胞。此外,還需考慮重復實驗的(de)需求,確保有足(zu)夠的(de)樣品供使用。

  3. 采樣時間(jian):盡量(liang)在生物鐘(zhong)節(jie)律(lv)的(de)同一(yi)階段進行(xing)取樣,因(yin)為某些基因(yin)的(de)表達水平可能(neng)會受到時間(jian)的(de)影響。

  4. 采樣(yang)方法:使用無菌操作,避免引入外界(jie)污(wu)染。快速冷凍樣(yang)品以防止RNase酶的活性,并(bing)盡快轉移到液氮中長期(qi)保存。

  5. 保存(cun)條(tiao)(tiao)件(jian):最佳的(de)保存(cun)條(tiao)(tiao)件(jian)是將(jiang)樣品迅速冷(leng)凍(dong)至-80℃,然后轉(zhuan)移至液(ye)氮罐中(zhong)長期儲存(cun)。如果條(tiao)(tiao)件(jian)有限,則可以先(xian)冷(leng)凍(dong)至-20℃,但需盡快(kuai)處理并轉(zhuan)存(cun)至更低溫環境中(zhong)。


產(chan)品名稱:PAXgene全血RNA管 樣本采集保(bao)存
產品貨號:762165
產(chan)品規格:2.5mL,100支(zhi)/盒

產品介紹(shao):
PAXgene血液RNA管旨在立即穩(wen)定細胞內(nei)(nei)RNA,從而產生準(zhun)確且可重(zhong)復的(de)基因表達(da)數據。PAXgene血液RNA管含有(you)一種專有(you)試(shi)劑,可在采集后立即穩(wen)定細胞內(nei)(nei)RNA。細胞內(nei)(nei)RNA在室(shi)溫(wen)下(xia)(xia)穩(wen)定長達(da)三天或(huo)在2-8°C下(xia)(xia)穩(wen)定長達(da)五天。PAXgene試(shi)管可以在-20°C至-70°C的(de)溫(wen)度下(xia)(xia)冷凍,以便長期儲存。

只有高質量的樣(yang)品才(cai)能提供準確可靠的數據,進一步(bu)推動我們對生命現象的理解(jie)和探(tan)索(suo)。希望(wang)這(zhe)篇文章能為您的學習和科研帶來一些啟示和幫助!