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BD Rhapsody 助力單細胞測序研究

更(geng)新(xin)時間:2021-07-13

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 單細(xi)胞(bao)測(ce)(ce)序(xu)技術(shu)自(zi)2009年問世,2013年被Nature Methods評為年度技術(shu)以(yi)來,越來越多(duo)地被應用在科研領域。自(zi)此(ci),單細(xi)胞(bao)測(ce)(ce)序(xu)技術(shu)被廣泛(fan)應用于基礎科研和臨床(chuang)研究

   單細胞在許多領域(yu)都占有一席之地,對于癌癥早期的診斷(duan)、追蹤以及個體化治療具有重要意(yi)義。

 

 

 

 

基本原理

 

 

   單(dan)(dan)細胞(bao)測序(xu)(xu)首先不是僅僅對一(yi)個(ge)細胞(bao)進(jin)行測序(xu)(xu),而是說該(gai)項技術能對單(dan)(dan)一(yi)細胞(bao)的基(ji)因組(zu)或轉錄組(zu)進(jin)行測序(xu)(xu),可以理解為單(dan)(dan)細胞(bao)水平上的測序(xu)(xu)。

   為什么要進行單細胞(bao)測序?世界上沒(mei)有(you)兩(liang)片(pian)相同的葉子,對于多細(xi)胞(bao)(bao)生物來說細(xi)胞(bao)(bao)與細(xi)胞(bao)(bao)之(zhi)間是(shi)存在差異的,很多時候是(shi)基因(yin)組、轉錄組上的失之(zhi)毫厘(li),功能上的差之(zhi)千里。比如在腫(zhong)(zhong)瘤組(zu)織(zhi)中(zhong),腫(zhong)(zhong)塊中(zhong)心的(de)(de)細(xi)(xi)胞(bao)與(yu)腫(zhong)(zhong)塊周圍的(de)(de)細(xi)(xi)胞(bao),原發灶與(yu)轉移灶的(de)(de)細(xi)(xi)胞(bao),其基因組(zu)與(yu)轉錄組(zu)等(deng)遺(yi)傳(chuan)信息(xi)是存在差異的(de)(de),這也就導致(zhi)不(bu)同(tong)腫(zhong)(zhong)瘤細(xi)(xi)胞(bao)表(biao)現(xian)出免疫特性(xing)、生(sheng)長速度、侵襲能力等(deng)表(biao)型(xing)方面的(de)(de)差異,最終導致(zhi)對不(bu)同(tong)抗腫(zhong)(zhong)瘤藥物的(de)(de)敏(min)感性(xing)不(bu)同(tong)或(huo)放療敏(min)感性(xing)的(de)(de)差異。
   傳統測序方法所展示的(de)信(xin)息也是(shi)在(zai)多細胞水(shui)平上的(de)平均信(xin)息,而單細胞水(shui)平上的(de)測序則*可以反(fan)應同(tong)(tong)一(yi)個細胞群(qun)里(li)不(bu)同(tong)(tong)細胞的(de)基(ji)因組和轉錄組狀況。單細胞測序技(ji)術(shu)的(de)出(chu)現,使得從混雜(za)的(de)樣(yang)品中篩選出(chu)異質性信(xin)息的(de)難題得以(yi)解決(jue),該技(ji)術(shu)的(de)成熟使用也(ye)必將生命科學研(yan)究向前邁進一大步

 

 

 

 

BD Rhapsody

 
 

   BD Rhapsody™單細(xi)胞(bao)分析系(xi)統(tong)應運而生(sheng),此系(xi)統(tong)的(de)誕(dan)生(sheng)基(ji)于 BD 在細(xi)胞(bao)生(sheng)物學(xue)領(ling)域 40年(nian)的(de)專(zhuan)業技術,克服了傳統(tong)檢測的(de)局限(xian)性,能(neng)夠對成(cheng)千上(shang)萬個單細(xi)胞(bao)的(de)數百個表(biao)(biao)達基(ji)因同時進行數字定量,每個細(xi)胞(bao)提取獨立數據,體(ti)現異質性,可以鑒定和表(biao)(biao)征新型和罕(han)見細(xi)胞(bao)類型,有(you)助于理解從(cong)免疫學(xue)到腫瘤學(xue)等多個領(ling)域內的(de)生(sheng)物學(xue)過程(cheng)。

 

  BD重磅推出的(de)(de)Rhapsody™單細(xi)胞分析系(xi)統克(ke)服(fu)了傳(chuan)統檢(jian)測的(de)(de)局(ju)限(xian)性,如微陣列(lie)和大量細(xi)胞 RNAseq,傳(chuan)統檢(jian)測依賴(lai)于對多個細(xi)胞的(de)(de)平(ping)均(jun)檢(jian)測,來實現對細(xi)胞間(jian)微妙差異的(de)(de)觀察。與其他(ta)單細(xi)胞分析系(xi)統相(xiang)比(bi),BD Rhapsody™的特點及優勢在于:

 

1.更高的采樣靈敏(min)度

靶(ba)向分(fen)析(xi)(xi)方(fang)法有(you)助于(yu)提(ti)高單細(xi)胞(bao)測(ce)(ce)序效率,Rhapsody系統(tong)提(ti)供(gong)的檢(jian)測(ce)(ce)試劑盒(panel)可穩定的重(zhong)現細(xi)胞(bao)異質性的數(shu)據,可用于(yu)探索(suo)與眾多應用相(xiang)關的細(xi)胞(bao)類型。且(qie)與全(quan)轉錄(lu)組擴增的mRNA分(fen)析(xi)(xi)相(xiang)比,Rhapsody系統(tong)對罕見轉錄(lu)有(you)更低的檢(jian)測(ce)(ce)閾(yu)值。

 

2.克服 PCR 偏(pian)差 — BD分(fen)子標簽

當(dang)對序列讀取進行計數時,PCR 擴(kuo)增偏(pian)差可導致基因定量不準確。Rhapsody采(cai)用(yong)“分子標(biao)(biao)簽(qian)”技術,能為單細(xi)胞(bao)(bao)中每個轉錄(lu)本標(biao)(biao)記特異性分子標(biao)(biao)簽(qian),實現了單細(xi)胞(bao)(bao)水平(ping)上基因表達(da)譜的絕對定量,同時,每個細(xi)胞(bao)(bao)也會被標(biao)(biao)記特異性細(xi)胞(bao)(bao)標(biao)(biao)簽(qian),這使高通(tong)量平(ping)行建庫成為可能。

 

3.單細胞成像系統

對單細胞(bao)分離過程進行質(zhi)控,監控細胞(bao)存(cun)活率(lv)、單細胞(bao)分離效(xiao)率(lv),有(you)效(xiao)保證實驗(yan)成功率(lv)。

 

4.更高的轉錄本檢測特異性

系統通過(guo)*的數(shu)據分析流程(cheng),去(qu)除PCR錯誤擴增產(chan)物,降(jiang)低細(xi)胞(bao)非特異性表達水平。

 

5.更高的(de)分辨率

可以(yi)分辨更細分、微觀的細胞群和細胞亞種群。

 

6.更經濟的(de)測序和(he)設備預算

結合(he)Rhapsody*的單(dan)細胞分離(li)技術,單(dan)次實(shi)驗(yan)可制(zhi)備100-10000個(ge)單(dan)細胞文庫,用戶可根據需(xu)求(qiu)定(ding)制(zhi)引物,將檢測(ce)(ce)范圍集中(zhong)在目標基因,大幅降低后續(xu)測(ce)(ce)序成(cheng)本(ben)。

 

 

   隨著(zhu)人們逐漸意(yi)識到單(dan)細胞(bao)研究對認識人自(zi)身以及(ji)疾(ji)病的(de)(de)重要性(xing),單(dan)細胞(bao)測(ce)序技(ji)術(shu)的(de)(de)誕生恰逢其時(shi)。目前單(dan)細胞(bao)測(ce)序已經廣泛(fan)用于微生物學、神經學、人體發(fa)育、免疫、癌癥(zheng)、輔(fu)助(zhu)生殖等領域(yu)的(de)(de)研究。相(xiang)信此次BD Rhapsody單(dan)細胞(bao)分析系統的(de)(de)閃亮登場(chang),能夠為目前高(gao)速(su)發(fa)展中的(de)(de)精準醫學帶來濃(nong)墨重彩的(de)(de)一筆(bi)。